Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms