Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms