Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms