Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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