Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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CLDN19Q8N6F1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CLDN19Q8N6F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CLDN19Q8N6F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CLDN19Q8N6F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLDN19Q8N6F1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLDN19Q8N6F1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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