Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms