Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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