Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms