Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms