Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms