Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms