Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms