Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms