Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PERM1Q5SV97 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms