Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms