Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms