Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC92Q53HC0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms