Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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