Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPRNQ4KMQ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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