Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FHOD3Q2V2M9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms