Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEP1BQ16820 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms