Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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