Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms