Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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