Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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