Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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UBE3CQ15386 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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UBE3CQ15386 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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UBE3CQ15386 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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UBE3CQ15386 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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