Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TTF1Q15361 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TTF1Q15361 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TTF1Q15361 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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