Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD1Q15327 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms