Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms