Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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