Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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