Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSHL1Q14406 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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