Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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