Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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