Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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