Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms