Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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