Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ITGB3BPQ13352 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ITGB3BPQ13352 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ITGB3BPQ13352 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ITGB3BPQ13352 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ITGB3BPQ13352 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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