Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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