Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms