Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SEMA3BQ13214 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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SEMA3BQ13214 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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