Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms