Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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