Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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