Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms