Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD47Q08722 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms