Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms