Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms