Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3AQ05086 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms