Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAV1Q03135 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms